La desesperación sigue en una nueva forma en Danganronpa Ultra Despair Girls! Protagonizada por la hermana de Makoto, protagonista de Danganronpa the Animation, enlaza los hechos sucedidos entre el primer y el segundo manga de Danganronpa que hemos publicado. Komaru Naegi lleva un año secuestrada y no sabe nada ni de sus secuestradores ni de su familia. Al final consigue escapar y cuando sale fuera La ciudad ha sido tomada por un ejército de Monokumas controlados por unos niños conocidos como Guerreros de la esperanza ! Después de verse metida en otro horrible juego en el que los niños cazan adultos, es rescatada por Touko Fukawa (otra conocida de la saga), que usando unas tijeras la ayuda a escapar. Komaru tiene una nueva amiga con la que escapar Pero Touko tiene otra personalidad demente llamada Genocide Syo! ¿Serán capaces las dos de colaborar y de escapar de esta horrible pesadilla?