Fullmetal Alchemist revela, al fin, el origen de los hermanos Elric, sus primeros pasos en la alquimia y el funesto accidente que dio origen a su búsqueda de la piedra filosofal.

Tras reencontrar a su maestro, Edward y Alphonse Elric recuerdan su pasado, su formación como alquimistas y la peligrosa transmutación en la que perdieron sus cuerpos. Mientras tanto, en el seno del ejército, un terrible peligro se cierne entre los alquimistas del estado.