Guignebert inicia su investigación con un estudio de la figura de Jesús y su lugar dentro de la vida religiosa de su comunidad. Después analiza la obra de los apóstoles y el suelo espiritual en el que sus enseñanzas habrían de producir los primeros frutos, para llegar a san Pablo, quizá el hombre de mayor importancia para la consolidación de la religión cristiana. En los últimos capítulos expone las razones históricas de la organización jerárquica definitiva de la Iglesia católica y su triunfo sobre el Estado y la sociedad de los romanos, triunfo político que proporciona la base para el poder de la Iglesia hasta nuestros días.